Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms