Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LMTK3Q96Q04 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms