Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms