Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OPALINQ96PE5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 490.1 ms