Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EP400Q96L91 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms