Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED3Q96IU2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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