Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMD4Q96H15 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMD4Q96H15 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMD4Q96H15 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMD4Q96H15 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMD4Q96H15 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms