Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF428Q96B54 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF428Q96B54 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms