Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms