Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms