Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms