Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNRF4Q8WWF5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRF4Q8WWF5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms