Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms