Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms