Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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