Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms