Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD1Q8NA66 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD1Q8NA66 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms