Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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