Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RYBPQ8N488 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms