Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms