Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms