Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNMB4Q86W47 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms