Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q71RC1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q71RC1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q71RC1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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