Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBC1D9Q6ZT07 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBC1D9Q6ZT07 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms