Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00575Q6W349 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms