Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms