Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms