Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZCCHC12Q6PEW1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms