Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6P435 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q6P435 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6P435 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms