Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms