Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms