Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYOM3Q5VTT5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms