Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SAMD5Q5TGI4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms