Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRMS1LQ5PSV4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms