Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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