Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB6CQ53S08 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms