Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms