Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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