Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms