Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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LY6EQ16553 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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