Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CRY1Q16526 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRY1Q16526 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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