Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL1Q16048 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PMCHL1Q16048 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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