Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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