Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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