Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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