Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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