Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms