Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms