Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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