Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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